Devletin son dönemlerinde ortaya çıkan kıtlık,açlık ve salgın hastalıklar sebebiyle devlet dağılmış; Çin sınırlarında farklı adlarla (Kansu Uygur Develeti, Turfan Uygurları) bir sure varlıklarını sürdürmüşler ve Moğolların haki